以下是北京港澳通行证签注的办理流程：

1、准备材料：本人身份证、港澳通行证、近期免冠照片等。

2、填写申请表：前往当地出入境管理机构领取或在网上下载《中国公民出入境证件申请表》，如实填写个人信息。

3、提交申请：将填好的申请表和相关材料一并提交给出入境管理机构，并缴纳相应的签注费用。

4、等待审批：出入境管理机构会对申请进行审批，审批时间一般为 5-10 个工作日。

5、领取签注：审批通过后，前往出入境管理机构领取签注。

建议参考：

1、提前了解签注类型：不同的签注类型适用于不同的情况，如个人旅游、团队旅游、商务等，根据自己的需求选择合适的签注类型。

2、注意签注有效期：签注的有效期一般为 3-6 个月，在有效期内使用，过期后需重新办理。

3、遵守相关规定：在港澳地区期间，需遵守当地的法律法规和社会公德，不得从事违法犯罪活动。

相关法条： 《中华人民共和国出境入境管理法》第十条规定：中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定，具体管理办法由国务院规定。