港澳通行证签注网上续签后，一般需要 3-5 个工作日才能生效，具体生效时间可能会因地区、政策等因素而有所不同。

建议参考：

1、在网上续签港澳通行证签注后，建议耐心等待生效时间，如果需要在短时间内前往港澳地区，建议提前办理签注手续，以免耽误行程。

2、可以通过官方网站、微信公众号等渠道查询签注的办理进度和生效时间。

3、如果签注在规定的时间内没有生效，可以联系当地的出入境管理部门咨询原因。

相关法条：

《中华人民共和国出境入境管理法》

第十条 中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定，具体管理办法由国务院规定。