问题解答：

客户要扣款开增值税发票如下：之前没有开具发票的，可将扣款项开在同一张增值税发票上。即同张发票上一行开具正常结算货款，下一行以负数开具扣款项。之前已经开具发票，可再开具一张红字发票，由对方开具红字发票信息通知单。

依据：

《中华人民共和国发票管理办法》第十九条

销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票；特殊情况下，由付款方向收款方开具发票。

《中华人民共和国发票管理办法》第二十条

所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项，应当向收款方取得发票。取得发票时，不得要求变更品名和金额。

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