农村合作医疗住院报销是有上限的。

建议参考：1. 在住院前，了解当地农村合作医疗的报销政策和规定，包括报销比例、报销上限等，2. 保留好住院期间的所有费用清单、发票等相关凭证，以便在报销时使用，3. 如有疑问，可以咨询当地农村合作医疗管理部门或医疗机构的工作人员。

相关法条：《中华人民共和国社会保险法》第二十四条规定：国家建立和完善新型农村合作医疗制度，新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。