社保住院直接报销时，通常不会在出院时直接扣除个人应承担的费用，一般情况下，社保会在结算时将符合规定的医疗费用直接支付给医院或医疗机构，而个人需要支付的部分则通过其他方式进行结算，例如现金、银行卡或医保个人账户。

建议参考：

1、在住院前，了解自己的社保政策和报销范围，包括起付线、报销比例、最高限额等信息。

2、保留好所有的医疗费用发票和相关凭证，以便在报销时使用。

3、按照社保要求的流程和时间进行报销申请，一般需要在规定的时间内将相关材料提交给社保部门。

4、如有疑问或需要帮助，可以咨询社保经办机构或相关部门，了解具体的报销流程和要求。

相关法条：

《中华人民共和国社会保险法》第二十八条规定：符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

需要注意的是，具体的社保报销政策可能因地区和具体情况而有所不同，在进行社保住院报销时，最好参考当地的社保政策和相关规定，以确保能够顺利获得报销。