信用卡逾期被扣的钱是否能算本金，取决于具体情况，信用卡逾期后，银行会按照合同约定收取逾期利息和滞纳金等费用，如果银行在扣除这些费用后，还有剩余款项，那么这些剩余款项可以算作本金，如果银行在扣除这些费用后，不足以弥补逾期欠款，那么银行可能会继续向你追讨欠款，包括逾期利息和滞纳金等费用。

建议参考：如果你发现信用卡逾期被扣的钱与你预期的不同，你可以先联系银行客服，了解具体情况，如果银行的扣费不合理，你可以向银行投诉，要求银行退还多余的款项，你也可以向银保监会投诉，维护自己的合法权益。

相关法条：

1、《中华人民共和国民法典》第六百七十六条规定：借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。

2、《中华人民共和国商业银行法》第四十二条规定：借款人应当按期归还贷款的本金和利息，借款人到期不归还担保贷款的，商业银行依法享有要求保证人归还贷款本金和利息或者就该担保物优先受偿的权利，商业银行因行使抵押权、质权而取得的不动产或者股权，应当自取得之日起二年内予以处分，借款人到期不归还信用贷款的，应当按照合同约定承担责任。