有了港澳通行证，是否可以线上签注，取决于当地的政策和规定，目前，一些地区已经开通了港澳通行证的线上签注服务，申请人可以通过相关网站或 APP 进行申请，但也有一些地区仍然需要申请人前往出入境管理部门办理签注手续。

建议参考：

1、申请人可以先查询当地出入境管理部门的官方网站或咨询客服，了解具体的签注政策和办理流程。

2、如果当地支持线上签注服务，申请人可以按照要求提交申请材料，并缴纳相应的费用。

3、如果需要前往出入境管理部门办理签注手续，申请人可以提前预约，并携带相关材料前往办理。

相关法条： 《中华人民共和国出境入境管理法》第十条规定：中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定，具体管理办法由国务院规定。