重庆灵活就业医保住院报销是有限额的。

建议参考： 灵活就业人员参加职工医保，缴费基数为上年度全市全口径城镇单位就业人员平均工资的 60%，缴费比例为 8.5%，其中缴费基数的 2%计入个人账户。

相关法条： 《中华人民共和国社会保险法》第二十八条规定，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

需要注意的是，医保政策可能会根据地区和时间的不同而有所变化，建议您关注当地医保部门的最新政策和规定。