港澳通行证签注自助机无法办理可能有以下原因：

1、设备故障：自助机可能出现故障或维护，导致无法正常使用。

2、证件问题：港澳通行证可能过期、损坏或信息不完整，也会影响签注的办理。

3、签注类型限制：某些特殊类型的签注可能无法通过自助机办理，需要前往柜台办理。

4、系统问题：可能是签注系统出现故障或维护，暂时无法使用自助机办理。

建议参考：

1、检查证件：确保港澳通行证在有效期内，且信息完整无误。

2、查看自助机状态：在使用自助机前，先查看机器是否正常运行，有无提示信息。

3、选择柜台办理：如果自助机无法办理，可以前往出入境管理部门的柜台咨询工作人员，了解具体办理流程和所需材料。

4、关注官方通知：及时关注出入境管理部门的官方网站或公告，了解自助机的维修和开放情况。

相关法条：

《中华人民共和国出境入境管理法》第十条规定：中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定，具体管理办法由国务院规定。

需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况可能因地区和政策而有所不同，在办理港澳通行证签注时，建议提前了解相关规定和流程，并按照要求准备好所需的材料，以确保顺利办理。