深圳港澳通行证可以网上办理，以下是办理流程：

1、登录深圳市公安局出入境便民网（https://www.sz3e.com/），点击“网上申请”。

2、选择办理类型，填写个人信息，上传照片。

3、选择预约时间和地点，缴纳费用。

4、按照预约时间前往指定地点办理。

建议参考：

1、办理前需准备好本人身份证、照片等材料。

2、填写个人信息时需如实填写，如有虚假信息将影响办理结果。

3、预约成功后需按时前往办理，如未按时前往需重新预约。

4、办理过程中需遵守相关规定，如不得携带违禁物品等。

相关法条： 《中华人民共和国出境入境管理法》

仅供参考，具体办理流程和要求以深圳市公安局出入境便民网公布的信息为准。