农村合作医疗是可以报销住院输血费用的，具体的报销比例和报销金额可能因地区、医院、病种等因素而有所不同，农村合作医疗可以报销输血费用的一部分，但是需要注意的是，输血费用的报销可能有一定的限制和规定，例如输血的适应症、输血的种类和剂量等。

建议参考：在住院输血前，建议咨询医院的医保部门或农村合作医疗管理部门，了解具体的报销政策和规定，在住院期间，需要保存好相关的医疗费用发票和病历等资料，以便在报销时使用。

相关法条：《中华人民共和国社会保险法》第二十八条规定，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。